高浓度无机物悬浮废水的处理：高浓度无机悬浮废水是一类不可生化降解的废水, 传统工艺一般采用化学絮凝及处理法。文献中指出微生物絮凝剂也可用于高岭土、泥水浆、粉煤灰等水样处理中, 在试验中通过用微生物絮凝及处理陶瓷厂废水, 釉药废水和坯体废水OD660 和浊度去除率高达96 .6 %。文献〔16〕用微生物絮凝及处理高浊无机废水时指出, 其沉降率是阳离子聚丙烯酰胺的2 .5 倍, 是阴离子聚丙烯酰胺的4 倍。
　活性污泥：活性污泥的收集和处理是水处理工程中令人头痛的问题, 活性污泥处理系统的效率常因污泥的沉降性能变差而降低, 在活性污泥中加入微生物絮凝剂时, 可使污泥容积指数能很快下降, 防止污泥解絮, 消除污泥膨胀状态, 从而恢复活性污泥沉降能力, 提高整个处理系统的效率。文献由红平红球菌制得的微生物絮凝剂NOC -1 加入已发生膨胀的活性污泥中, 可是污泥的SV I 从290 降到50 。