近年来，丽水农业产业化进程很快，成效显著，但当前也面临着不少问题与矛盾，较大地制约着农业产业化的更大推进。这些问题与矛盾主要表现在以下4个方面：

一、思想认识还没有真正到位

尽管从中央到地方各级政府都把农业产业化作为当前解决“三农”问题的主要抓手，但仍有不少人对推进农业产业化经营未引起高度重视。特别是一些处在“三农”问题第一线的基层政府人员，还存在着对农业产业化的认识偏见，把农业产业化理解为只局限于抓龙头企业和基地建设，以至造成了产业链联接脱节、顾此失彼而挫伤农民的积极性。

二、农民组织化程度低

市场与农户的联接、订单农业等缺乏诚信，缺少制度约束。这实质上反映了企业与农户、公司与农户、市场与农户之间并没有建立起真正的信用关系，也造成政府对企业与农户、市场与农户之间的利益协调困难。

三、农业标准化不高

农业产业化的过程缺少规范和一套有效的监控措施，冲破农产品“绿色壁垒”有待进一步提高。如茶叶，目前有20%左右因农残问题而达不到出口标准；香菇因早醛等化工、农残问题达不到出口日本、韩国的标准；水果因农残问题出口不足总量的5%。另外，国内“菜篮子”工程的实施及市场准入制的建立和完善，也急需我们加强农产品质量安全工作，否则我们的产品将被拒之门外。

四、体制缺陷阻碍产销联合

现行的农业、农村经营管理体制是长期以来计划经济体制下的产物，带有明显的计划色彩。农业、农村多头管理，导致外贸、购销、加工、贮藏等管理与服务相脱节，不少优惠政策难以落到实处，甚至出现“有利都来索，有难都回避，有功争着要”的怪现象。