肝功检查中最基本、最重要的指标就是转氨酶，通常包括血清谷丙转氨酶(ALT)和谷草转氨酶(AST)两项。谷丙转氨酶主要存在于肝细胞原浆的可溶部分，肝细胞发生炎症病变，引起细胞肿胀、坏死或肝细胞膜通透性增高等，均可使谷丙转氨酶释放于血液循环中，而使血清谷丙转氨酶增高。谷草转氨酶主要存在于肝细胞线粒体内，当肝脏发生严重坏死或破坏时，才能引起谷草转氨酶显著升高。
两项转氨酶的正常值，都在40个国际单位以下，超过40个国际单位就可确认为肝功异常。根据肝炎诊断标准，对于慢性乙肝患者病情的严重程度，可以按照轻、中、重度划分，如果谷丙转氨酶为40～120单位/升之间，称为轻度乙肝;谷丙转氨酶为120～400单位/升之间，称为中度乙肝;谷丙转氨酶大于400单位/升，成为重度乙肝。谷丙转氨酶与谷草转氨酶比值的大小在判定病情发展程度时有重要意义。一般来说，病程短、肝细胞实质损害轻、预后较好者，通常表现为谷丙转氨酶升高显著，谷丙转氨酶：谷草转氨酶比值大于1.5;病程长、慢性化程度高、肝细胞实质损害重、预后较差者，通常表现为谷草转氨酶显著升高，谷丙转氨酶：谷草转氨酶小于1.0，一般情况下，早期肝硬化及肝硬化患者的谷丙转氨酶：谷草转氨酶比值均在1.0以下。慢性肝炎患者转氨酶数值老是居高不下，反映肝细胞炎症始终未停止，肝细胞肿胀、坏死持续存在。