近年来，微波技术广泛应用在环保领域。微波处理污泥主要是利于微波的热效应和非热效应。所谓的热效应是指将微波能转化为污泥升温的热能而对污泥加热。污泥的非热效应是指微波与污泥中生物活性组成部分( 如蛋白质酶) 或混合物( 如细菌、霉菌等) 等相互作用, 使它们的生物活性得到抑制或激励( 视微波电磁场的频率和强度等因素, 以及污泥生物活性灭活阈值而定)。微波辐射加热污泥主要以加热均匀，热效率高、能进行选择性加热、强场高温和高频高温、穿透能力强，热源与加热材料不直接接触、反应过程易于控制和杀菌作用等优点。田禹等通过研究发现，适度的微波辐射能够改善污泥结构和脱水性能，但是过量的微波辐射时间会使微生物细胞壁结构破坏，胞内物质溢出，污泥脱水性能恶化。傅大放等认为直接利用微波技术干燥剩余污泥在技术上可行，但是经济上不可行。Eskicioglu 等对比研究了微波和传统加热对污泥厌氧消化性能的影响。他认为微波辐射和传统加热到96℃都能有效破坏复杂的活性污泥絮体结构和释放细胞内外生物高聚物。并且通过测定潜在甲烷的产生量，微波辐射更能够促进污泥嗜温厌氧消化，这主要是由于微波的非热效应。