根据《私募基金登记备案常见问题解答》中的相关规定，私募基金管理人应参照协会发布的《私募投资基金管理人内部控制指引》《私募基金管理人登记法律意见书指引》等规定制定并上传相关制度。制度文件包括但不限于（视具体业务类型而定）运营风险控制制度、信息披露制度、机构内部交易记录制度、防范内部交易、利益冲突的投资交易制度、合格投资者风险揭示制度、合格投资者内部审核流程及相关制度、私募基金宣传推介、募集相关规范制度，以及适用于私募证券投资基金业务的公平交易制度、从业人员买卖证券申报制度等。除此之外，申请机构还应该制定《投资者适当性管理办法》《财务管理制度》《人力资源管理制度》《基金托管与外包业务管理制度》《股东会议事规则》《总经理工作细则》《关联交易管理制度》等。

申请机构应当注意运营与内部制度与自身员工数量、组织架构、业务类型等相匹配，相关制度可在专业人士的指导协助下制定。