微生物絮凝法是利用微生物或其分泌物产生的代谢产物来处理废水，是具有生物分解性和安全性的的水处理法。刘其友等人采用吡啶筛选法得到微生物絮凝剂产生菌株B61, 其絮凝率达到92.5%。李政筛选出5 株微生物絮凝剂产生菌菌株,通过实验确定在培养时间为48 h,初始pH 为7，摇床转速为160 r/min、碳源为葡萄糖、氮源为蛋白胨(NH4)2SO4(质量比为1︰1)条件下对含油废水中浊度、石油类物质和COD 的去除率分别达到93.45%、53.42%和20.98%。罗一菁等从油田采出液污水中筛选得到一株微生物絮凝剂ＷＺ，分析了ＷＺ微生物絮凝效果，发现在35 ℃、170 r/min 摇床振荡培养29ｈ，投加量为25 mL/L，悬浮物去除率达到47.76％。微生物絮凝虽然安全高效但还存在一些问题，如研究水平略低，絮凝剂成本略高，测定絮凝剂活性指标单一，絮凝机理尚且无明确解释，废水类型与絮凝剂种类、成分等关系针对性不强等，还需深入研究。