1907年5月，安徽高等学堂发生风潮，严复由上海返安庆；6月辞学堂监督一职离开安庆回上海；7月到南京主持留美学主官考。（《严复的一些史实》之一百七十八）
严孝潜
当天有二个学生作揭帖三道：第一道，声讨“伪监督”严复；第二道，詈严复聘请来的斋务长周献琛“备极丑诋”。第三道，则波及到严复聘请来的闽籍教员。中午时分掀翻饭桌，並驱逐斋务长。（《严复集》补编，第89页）
当时严复尚在上海，得悉后，“则电嘱各教员管理（员），照常上课办事候处分”。（《严复集》补编，第89页）
当天，在安庆高等学堂任监学兼英文教员的严复的侄儿严家驺（字伯鋆）给严复写信汇报了学校发生的事件。（《严复集》第三册第826页）
同日，严复“除电学堂，将为首滋事学生牌示开除外，并电中丞另派监督，准我辞馆”。（《严复集》第826页）
严复在信中说：“本晚得十四寄缄，读之伤神无已。吾不为诸同事悲，亦不止为皖人悲，痛中国学界之不可救药也。此事十三日酉剖已有人电至上海《神州日报》馆，令其宣布，诋鼎观为卑鄙横态，被逐矣。而戌刻又一电云，学生借饭蔬为口实，掀翻廿槕，殴逐教员，哄堂罢课。据此，则暗中有人妬嫉吾校之整肃森严，欲令出此，与他校一律被讥；或有人欲解散成局，从中得利。故极力煽动，使皖人为此，而生徒侚瞀无识，隨其术中。又以前者求毕业之不遂，平素教督之认真，遂蠢然起而为此。此其愚可闵，其悍可恨；而其为蚍蜉憾事，露此丑态，又可笑也。嗟呼！此曹尚足教诲矣乎！故本日除电学堂，将为首滋事学生牌示开除外，并电中丞另派监督，准我辞馆。但前一事若办得动，同事诸子尚可暂留，以觇后効，再定行止若办不动，则诸子亦可以去矣。” “本日午后又接两电：一是十六四点，不知何人所发，文云：‘全校解散，君勿来。皖上公叩。’又一电是十七四点，常伯琦发，文云：‘请电复官绅，以联交宜。’第一电恐亦是反对者所为。总之，自前年姚叔子拉我监督此堂已来，其时有人隐隐反对，累缄来诅，而叔节不为之动，嗣经去年整理，无懈可击，舆论翕然。至于今年，留学生回国多人，以谓皖之学堂须皖人得其利益，深忌吾曹，固无中生有，出而为此，周鼎观特其借题。外来事势，人情如此，虽以苏格拉底、孔子为之，风潮亦难免耳。好是吾曹去就分明，皖人自负我辈，我辈未尝负皖人也。愚刻专看中丞回电如何，再行定止，三日内必有决断。诸公少待，何如？见皖中绅士时，为我深道歉衷。所未一一回电者，因来电至七八通，且不知洪朗翁、方伦老诸公居址，己托提学致意，万乞海涵而已。” （《严复集》第三册第826页）
同日，上海《神州日报》报道说：“十三日高等学堂学生与斋务长冲突各节，业纪本业矣。兹据皖省学界来信云及肇事原因，系因去岁附设师范科当试验毕业时之分数，均为斋务长周鼎观以一己之爱憎暗中加减，至有可及毕业者降而列休业；又有分数不及毕业者反得毕业。又甲班（分甲乙丙丁戉已等班）旧学生杨谷仁在堂肄业已有六七年之久，因年考一日稍差，即遭革除。” “且以监督接办时，定科生五年毕业，学期过远。每届考试倘分数稍有差池，势必斥革。”而“监督又远处沪上遥领其事，遂发生逐斋务长之事”。
《神州日报》还报导说“十八日安庆电：严监督密电提学司，即于翌日到皖，将革逐滋事学生，学生益激昂”。
1907年6月
严复到安庆后，立则就去拜谒恩铭，提出辞职要求，但恩铭慰畄甚至。又谒提学使沈曾植，再提辞职要求，均未获准。（《严复集》补编，第89页）
当日，严复在安庆给甥女何纫兰回信。
严复在信中说：“安庆之事一言难尽。本日得甥书，有云风平浪静，众魔悉伏。此因见皖抚来电，语极谦和，故有此想，不知事势与电全不相符，故我决然辞差。现拟廿六即行，搭船往南京。以应端督之电。既行之后，不复来矣。高等学校之有风潮，实因官界与我挟妬反对，而绅界则以学堂为利薮，各思分肥。而学生一因去年沙汰之多；二因求请毕业不遂；三因夏考在即，恐复被沙汰；周鼎观汉文欠通，平日办事过于沾沾自喜，开罪多人。总此数因，于是有十三日之风潮。当日之事原可劝阻即定，而提学司故纵之。现在官界唯一抚台，绅界惟姚叔节一人，余非反对，即系隨风，故吾断无更留之理。皖人唯恐吾之不去，于是在《南方》、《神州》诸报极力布散谣言，备诸丑诋。来书谓有识之士孰不敬仰，奈有识者甚少何哉？抚台相留虽切，然吾要以必将滋事二十余人办到，吾乃可留。抚台商之提学，提学方且吃醋，谓周鼎观该逐，而陈寄、谢师衡等，则称为豪杰之士，故学生闹事后，公然自首十二人，而学台略退五人以相敷衍，而学生要挟胁从之风愈炽。刻安徽大绅士则谋监督，小绅士则谋管理杂差，真所谓一骨裁投狗乱争矣。至学堂吾所用之管理、教员，大抵多站不住，因提学司曾赴日本，带有得意速成留学生数人，正无处位置故也。提学脑筋有病，素为名士，人极糊涂；至学务尤为外行，加以炻吾名盛，口里恭惟，背后反对，此堂之事，皆此老之助成也。嗟嗟！学堂本教育之地，而小人视为利薮，学生劣者不可沙汰，沙汰即起风潮，此后学界尚可问手？”严复还告知：“吾到南京，当有十日担阁。廿六由此即行，初一二乃考出洋赴美学生，事毕即当回沪，因复旦叶仲裕亦在彼捣鬼故也。吾到南京，必将种种情节告知端方，若意思不对，便亦辞去不办。此意可告汝父知之。吾来此，体气粗安，毋庸远虑。汝到医院未？病势何若？吾极悬悬也。” （《严复集》第三册第835页）
叶仲裕（景萊）原是复旦公学庶务，挪用学校存款三千元，屡催不能照缴，严复在2月上旬给端方信中提出“应准由复开除，以维校政。”叶仲裕还是上海《神州日报》创办人之一，主张革命，与主
当时即有人对陆均进行恫吓，同时並有学生向严复投递匿名“公愤书”，要严复尽快辞职。在这种恶劣的氛囲下，教务长姚永概也非常的无奈，劝说严复洁身自去。（《严复大传》第301页）
同日，严复回信给提学司沈曾植。
严复在信中讲：“承再损书，若怨仆不相师而委隆谊于草莽者，虽然，公亦未察鄙陋所居事势，有万不得已。何则？斋务长之率职，夫有所受之者，监督是也。故斋务长当位行权，行监督之权。学生恶之，姑无论其当否，岂不宜先告监督？乃今聚众自逐之，是谓监督权废，以复监督已废之权办滋事者，不可为也。且其事不止此，闻逐周之顷，先有讨监督之檄文，后则上海《南方》、《神州》各报日日有毁誉监督之论说，皆由皖寄去。复在沪之日，又有阻行之电；直至今日，尚有匿名投所谓公愤书者，公意以此为莫须有之流言，流言固矣。而流言之原因，非莫须有者也。盖其心所欲急击而去之者，监督耳；斋务长已墮之甑，非儿曹之所顾也。大学生狞犷如是，则其所阴持可知。乃来教尚欲复超两造之外为裁判为主，公所言欲谁欺乎？昨日姚教务长出留闽籍教员，则投匿名揭贴詈之矣；本日学生陆均者略出公道之言，为此校惜监督之去，则有恫喝使噤者矣。试问校中如此，仆尚可一日安其位手？犬马之年，五十有五，客气都尽，诚不欲为悻悻之小丈夫。
公又教以收复师生感情为主义，又云已退五名之外，不可追究，意即以此为收复感情之术。然复闻宥人而其人感者，必其权门之下者也，若吾力所不能制，是乞和解滋益骄耳，尚何感情之与有？肇事之众，不过二十余人，外是皆被胁持者；昨有单呈中丞，度已授公矣，何待函告？公自任为复外护，而于事则使其必不可留如此，复愚，诚不识所以护之者居何等也？” （《严复集》第三册第590页）
最后，严复告知“明日有便轮东去，吾为万里之鸥矣！”
当日，姚永朴、姚永概昆仲与皖绅方叔伦、邓绳候在孝涞屋为严复公饯送行。安徽教育会会长蒯光典闻讯赶来，阻行挽留，他提出一个折中方案：严复不住校，仍然当监督，或且至少当名誉监督。严复谢辞了蒯光典的挽留，但蒯光典还未出门，后院中就起詈声，蒯光典只得作罢。（《严复大传》第301页）
严复虽然对学潮感到痛心，但对辞去监督一职，没有一点懊丧的神请，手拿一本书，谈笑风生地坐轿离开安徽高等学堂，乘船离开安庆。受到攻击的闽籍教学及管理人员也同时离皖。（《严复大传》第302页）
这次学潮的原因颇为复杂，就其起源而论，与严复的严格管理有关。严复的严谨求实态度与部份学生急功近利的心态形成尖锐矛盾。再有部份皖省官绅，认为皖省学堂应由皖人在教学、管理用人上得其利益，使学潮染上了狭獈的地域色彩。再者就是严复的个人弱点，也给反对者提供了口实，如除了巡抚严复不太去理会其它官员、喜用亲信或闽籍人士、吸烟等原因。另外，当时的政治气候、反对君主立宪者及报刊也给学潮起了助波推澜的作用。所以，这次学潮本身并无政治目的和进步意义，诚如安徽本省知情人士所言，这次学潮是安徽教育史上的一大耻辱。（《严复大传》第305页）
严复辞去安庆高等学堂监督后，曾写有一联语，赠给何纫兰：“不辞与世终难合，但恨无人粗见知。” （《严复集》补编第88页）具体写作时间不详。
这次严复来南京，本是应两江总督端方之聘，来主持苏、皖、赣三省官费留美学生考试。后因考试延期举行，严复就先行返沪。
1907年6月25月（五月十五），《直隶教育杂志》丁未年第8期刊登了严复撰写的《辞安庆高等学堂监督意见书》。
在该意见书中，严复详细敍述事情之经过，文末严复说“但恐局外诸公不察复之所以为皖校者，故不殚冗烦，谨敍颠末，而著其原因如此。” （《严复集》补编第89页）
1907年6月27月（五月十七），今天严复应郑孝胥与柯贞贤之邀，与“古微、季渚、啸桐、澄如、拨可、博泉共饮花如兰家。” （郑孝胥日记）第1097页）
1907年6月（五月），《寰球中国学生报》第5、6期刊登了严复译述英人倭斯弗著的《美术通诠》第三篇《古代鉴别》一文，以及严复所作《英文百科全书评论》。（《古代鉴别》和《英文百科全书评论》两篇文章，《严复集》及《严复集》补编，均未收录。）
1907年7月
第1111页）
严复在信中说：“廿二日一信想已接到，曹小姊是否来宁补考，祈即通知，因渠姊弟若决计不来，吾即无庸在此久候，卷阅清楚，即须回沪，此间无聊，度日若岁也。此番报名应考者，初系二百余人，即雌者亦有三十人左右。乃至临考，则男子仅七十余，而女子不过十零人而已。论其程度，尚不知能否挑到男十、女三。人才真难得也。女子程度尤浅，接到题纸，与其对觑，不能下笔；英文勉强写出半板，而文法亦多支离。王季昭甚为拼命，无如本领太低何也。其余务本女生，更不足论，勤读四五年，不识够得上应考否耳？若曹家姊弟肯来，包管可以入选。吾虽有出题阅卷之劳，所不辞也。”“汝入医院后，体中何如？廿五塾中散学，能一往否？甚念甚念？吾儿身体康复后，只须略略用功，杀却此辈有余也。南京天气甚热，日间汗出如洗，此自是表虚之故，老境迫人，不任劳顿。卷子幸有数人分看。伯鋆管数学一门，陈诸藻管理化一门，李登辉管历史、舆地，吾所自阅，只两种卷耳。其实早知人少，便不须李前来，但今既来，姑分一种与渠看，非我不能自了也。李同渠新娘来此，住其连襟家，在新街口，乐可知也。端方见过一面，复旦情节尚未与言，准俟考后提及。吾之旋沪，早则初一二，迟则初五六，看有人请补考否。这上午大雨倾盆，吾顷间刚从提学衙门晚餐回寓也。” （《严复集》第三册第836页）
严复在信中，述及留美学生官考情况和恩铭被杀事件：“昨接汝一缄，系廿三日所写，至廿六日始到。因其信系交信局，故尔稽延。此后，信可直投信箱，勿交信局为要。舅于本日卷始看毕，程度及格者不过五六人，其余虽送出洋，不能入大学堂肄业也。至于女生十余人中直无一人可及半格，三名之阙不知如何取补。人才难得如此。江、皖、赣三省讲求学务六七年，年费不下半兆银两，而认真考校时，成効不外如此，何异辇金以投楊子乎，可叹可叹！吾本日有电往中西女塾，问
严复在信中说：“接到廿五日缄，知因舅体气劣弱，儿挂怀无已，仁孝可感。刻定初五买舟回沪。原定初四，端帅不肯，更留一天。男生照原议送十人，女生照原议送三人。但程度皆不甚高，而女生尤不及格，只好送往中学堂，不能入大学堂也。
同日中午，端方设宴招待严复、李登辉等人。时在南京的郑孝胥也同时被邀。（《郑孝胥日记》第1099页）
这次考试“录取游学生正取十名，备取五名；女生正取三名，备取二名。”这是我国第一次官费女学生留学西方。（《神州日报》