从实际来看，小产权房的大量出现，必然伴随着大量农民失去赖以生存的土地，由于只是小产权房土地所有权属发生性质上的改变（明显违规的改变不了），农民的户籍以及在此基础上的医疗、养老、教育等方面的问题等却没有随之发生变化，这可能导致失去土地的农民陷入生活无着落的境遇。其次，大量小产权房的无序出现，可能导致严重的“恶意投资”--小产权房价格低廉，炒房者购买之后，即便无法办理房屋产权登记，但在一定时期内仅靠其租金等，就能大赚一笔。最后，小产权多集聚在集体土地上，而这些地方恰恰是地方政府缺乏统一、科学规划的地方，当大量的小产权房争先恐后地“无序”地出现，这可能为今后“有序”的地区域开发构成致命性的隐患和障碍。