因为生态农业建设最主要的目的是达到中国农村可持续发展，所以生态农业建设的发展方向也必需共同考虑经济、环境和社会 3 个方面。从经济上来说，生态农业建设作为一种社会投资，它的长期总回报必须大于总成本。没有足够的长期回报，便是亏本的生意，是没有持续性的。投资的成功与否取决于能否有效控制成本和赚取回报，其窍门是要精确计算和预计建设的成本与回报。然而，中国现今却缺乏一个健全的会计系统，将有形与无形、财政性与非财政性的成本与回报计算出来。现在中国的会计系统只能计算一些有形、财政性的项目，无形的环境成本并没有计算在内，以致真正的成本与回报的比例未能如实反映[14]。不健全的会计系统不但不能帮助有关部门了解问题核心的所在，更容易被利用为文过饰非的工具，令问题持续、甚至恶化下去。

　　 从生态角度来说，生态农业建设必须令生态环境更适于人民居住。狭义的生态环境，指自然的生态环境；广义的生态环境，亦包括人文的生态环境。人在生态环境中的要求是多方面的。要满足不同人、在不同时间的需要实不是件容易的事。例如：当中国农村社会十分贫困，人民要求的只是简单的温饱问题，环境的生产力便是最重要的考虑因素；但随着人民生活改善、衣食无忧的时候，人民所要求的可能便是一个优质的生活环境，这时候，环境的质量便最重要了。所以，生态农业建设必须具有弹性，即能满足不同人、在不同时间的需要。

　　 从社会方面来说，生态农业建设必须推动社会发展。现在中国农村仍然落后，存在着许多社会问题，例如：就业、教育、生产力低等等。建设生态农业可以说是一个契机，在引入新的生产系统的同时，缔造出一个新的社会环境。以就业为例，因为农村人口不断增加，但生产条件未改善前，劳动力不能充分利用，大量剩余的劳动力只得涌向城市。这不但是一种浪费，也给城市造成很大的压力。解决农村的剩余劳动力最好的方法是就地安排，发展劳动密集型的生态农业建设是其中一个很好的解决

　　方法。此外，现在一般的农业劳动大多是强体力劳动，劳动环境比较恶劣，老人和妇女等不能发挥作用。生态农业建设如能提供一个较好的劳动环境，让老人和妇女也可以投入生产，农村的劳动力便能进一步发挥作用。